Der Missouri Foxtrotter wurde in den 1820er Jahren im Bereich des Ozark-Plateaus in den amerikanischen Bundesstaaten Arkansas und Missouri gezüchtet und ist eine der ältesten amerikanischen Pferderassen.
Das Pferd wird speziell daraufhin gezüchtet, die Gangart des Foxtrott, d. h. das Pferd geht vorne und trabt hinten, auszuüben. Die Gangart ist sehr sicher und verhindert relativ gut sowohl eine frühe Ermüdung des Pferdes als auch das Bewegungen an den Reiter weitergegeben werden.
Sie sind besonders bei Ausdauerleistungen und im Gelände im Vorteil, weshalb die Missouri Foxtrotter heute auch von den Forestrangern der USA eingesetzt werden und bei den Amish sehr beliebt sind.
Weltweit gab es 2002 67.000 registrierte Pferde der Rasse, den größten Teil davon in den USA, wenige in Kanada, 265 in Europa, von denen 155 in Deutschland lebten.